Utrzymanie efektownej szaty maltipoo w czystości wymaga regularności. Czesanie powinno odbywać się co najmniej trzy razy w tygodniu, a w przypadku gęstszych loków nawet codziennie, aby nie dopuścić do powstawania kołtunów. Do pielęgnacji najlepiej sprawdza się szczotka z zaokrąglonymi pinami, która nie podrażnia delikatnego naskórka, lub szczotka typu pudlówka przy bardziej zwartej strukturze włosa. Uzupełnieniem domowej rutyny powinno być profesjonalne strzyżenie realizowane zazwyczaj dwa razy do roku. Kąpiele nie powinny być zbyt częste, aby nie pozbawić skóry naturalnej bariery lipidowej. Standardowo wystarczy mycie raz w miesiącu przy użyciu łagodnych, nawilżających kosmetyków dla psów, na przykład z dodatkiem owsa lub aloesu, które koją skórę. Zbyt częsty kontakt z wodą i detergentami prowadzi do matowienia włosa i świądu. W sytuacjach drobnych zabrudzeń pomiędzy kąpielami doskonałym rozwiązaniem są specjalne nawilżane chusteczki pielęgnacyjne.

Pielęgnacja maltipoo obejmuje również newralgiczne obszary ciała. Wokół oczu tych psów nierzadko tworzą się zacieki łzowe, które wymagają systematycznego oczyszczania dedykowanymi preparatami. Regularnej kontroli wymagają także uszy, w których ze względu na opadającą małżowinę mogą gromadzić się zanieczyszczenia. Bardzo ważnym elementem opieki jest profilaktyka stomatologiczna. Mycie zębów specjalną pastą enzymatyczną dla zwierząt powinno odbywać się co najmniej dwa do trzech razy w tygodniu, a najlepiej co drugi dzień, co chroni przed odkładaniem się kamienia nazębnego. Należy również kontrolować długość pazurów - jeśli słychać ich stukot o podłogę, to sygnał, że pora na skrót za pomocą gilotynki lub cążków dostosowanych do anatomii psiego pazura.

Średnia długość życia maltipoo wynosi od 10 do 15 lat. Mimo ogólnie dobrej witalności, psy te wykazują skłonności do alergii pokarmowych oraz problemów dermatologicznych. Wrażliwy przewód pokarmowy i delikatna skóra wymagają starannego doboru karmy oraz stałej obserwacji reakcji organizmu na nowe produkty. Ze względu na niewielką masę ciała oraz brak izolującego podszerstka, maltipoo są podatne na wychłodzenie podczas chłodniejszych pór roku. W polskich realiach jesienno-zimowych, gdy temperatury wyraźnie spadają, warto zaopatrzyć pupila w dobrze dopasowany sweterek lub ocieplany kubraczek chroniący przed wiatrem i mrozem. Wszelkie niepokojące objawy zdrowotne należy zawsze konsultować z lekarzem weterynarii.